Ligadas a SEGOV:
- Coordenadoria Especial de Apoio à Governança das Regionais – CEGOR
- Coordenadoria Especial de Programas Integrados – COPIFOR
Ligadas a GABPREF:
- Coordenadoria Especial de Relações Internacionais e Interinstitucionais – COERI
- Coordenadoria Especial de Políticas sobre Drogas – COESD
- Coordenadoria Especial da Primeira Infância – CESPI
- Coordenadoria Especial de Articulação Política – COEARP